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醫院污水是指醫院（綜合醫院、專業病院及其它類型醫院）向自然環境或城市管道排放的污水。其水質隨不同的醫院性質、規模和其所在地區而異。每張病床每天排放的污水量約為200-1000L。醫院污水中所含的主要污染物為：病原體（寄生蟲卵、病原菌、病毒等）、有機物、漂浮及懸浮物、放射性污染物等，未經處理的原污水中含菌總量達10^8個/mL以上。因此，關于醫院污水處理是個不得不重視的問題。
對于醫院機構來說，醫院污水主要來源于各科室，例如放射科、口腔科、病理科、手術室、各類檢驗室、門診、其他科室及病房、洗衣房、食堂、辦公室以及傳染科病房（所有含傳染病房的醫療機構統稱為傳染科醫院）。洗印廢液、放射性廢水、含鉻廢水、含貢廢水、酸性廢水、含氰廢水、其他生活類污水、洗衣污水、食堂污水、傳染病房污水等構成了醫療機構污水。而不同的污水處理方式不同，洗印廢液需要作為危險廢物由專業公司收集外運到醫院外進行處理，醫院內部不做處理；放射性污水則經過預處理后直接排放就可以了；含鉻廢水、含貢廢水、酸性廢水、含氰廢水、其他生活類污水、洗衣污水都是經過預處理后排放到化糞池，在經過污水處理站處理后才能排放；食堂污水經過隔油池初步處理后，排放至污水處理站再次處理后排放；傳染性病房的污水要排放至專用化糞池，進行預消毒后在經過去余氯，最后才到污水處理站進行處理后排放。
關于醫院污水排放進水水量的問題，其具體標準如下：
上表中需要注意三點：
1、新建醫療機構污水排放量應根據《民用建筑工程設計技術措施》建質[2003]4號進行取值設計；
2、污水排放量有實測數據的按實測數據；
3、用上表估算污水量時，經濟發達地區、設施完善的醫療機構取上限；設施比較落后的老醫療機構取下限。
而醫院污水進水水質要求如下：
上表中需要注意點如下：
1、新建醫療機構每張病床污染物的排污量可按下列數值選用：
BOD5：40-60g/床.d，CODcr：100～150g/床.d，懸浮物：50～100g/床.d；
2、污水水質有實測數據的按實測數據；
3、無實測數據時可參考上表水質。
醫院機構污水排放標準
而醫療機構關于污水處理，有六大原則：其具體為分類處理原則、全過程控制原則、就地處理原則、生態安全原則、達標與風險控制相結合原則、減量化原則。而其處理工藝選擇的原則有兩點：
1、處理出水排入下水道（下游設有二級污水處理廠）的綜合醫療機構推薦采用二級處理，對采用一級處理工藝的必須加強處理效果；
2、其他機構必須采用二級處理。
根據工藝處理原則，可將醫療機構分為傳染病醫療機構和綜合醫療機構；排放水體分為自然水體和市政下水道；處理工藝分為二級處理工藝和一級處理工藝，
一級處理工藝：
一級處理工藝主要作用是將病毒、病菌的顆粒物的去除以及殺毒功能，非傳染性醫療機構用水排出是先經過格柵，濾去殘渣，到調節池進行調節后，進行一級處理，處理后的污水在經過消毒然后才能排到城市污水管網。而經過一級處理工藝處理后產生的污泥，排放到污泥池，在經過污泥處理系統進行處理；若污泥中仍含有污水，再返回到調節池，再次進行一級重復處理。
二級處理工藝：
二級處理工藝除了將病毒、病菌的顆粒物的去除以及殺毒功能以外，還有個去除CODcr、BOD5、NH3—N等化學物質的功能，其主要處理過程為醫療機構污水經過格柵，濾去殘渣，到調節池進行調節后，在到生化系統進行處理，最后進行消毒，排放至城市污水官網自然水體。生化系統處理后部門污泥直接排入污泥池，進入到污泥處理系統。若未處理干凈的污泥會再次進入到格柵，重復處理分離。
綜合兩種處理工藝來看，污泥的產生主要是四種途徑：化糞池污泥、一級處理污泥、格柵柵渣以及生化處理污泥。而針對這些污泥，有兩種處理方式，一種是減量處理，一種是消毒處理。
在進行污水處理的過程中，也會出現一些廢氣，因為病毒從醫療機構水處理構筑物表面揮發到大氣中會造成的病毒的二次感染，所以進行廢氣處理也是很有必要的，廢氣處理主要有兩種方式，一種過濾消毒，一種抽風。
消毒技術主要有氯氣（Cl2）消毒，次氯酸鈉（NaOCl）消毒、二氧化氯（ClO2）消毒、臭氧（O3）消毒以及紫外線消毒。其具體的優缺點對比及消毒效果如下表：
在污泥處理過程中，有個環節是生化系統處理環節，生化系統有不同的處理工藝，其主要處理工藝有活性污泥法、生物接觸氧化工藝、膜—生物反應器、曝氣生物濾池，其各處理工藝具體優缺點對比如下表：
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